巫瑞波,教授,博导。

厦门大学本科(2006)、博士(2010),美国纽约大学(NYU)国家公派联合培养博士生、博后。2011年11月以“百人计划”副教授入职中大药学院,2017年1月晋升为教授。更多最新的课题组信息请查看主页http://www.qmclab.org

 

研究方向

量子药物化学(Quantum Medicinal Chemistry): 借助QM/MM(量子力学-分子力学组合方法)和MD(分子动力学)等多尺度模拟技术,在电子层次、动态水平研究药物化学、化学生物学关注的蛋白-配体、蛋白-蛋白相互作用问题。以酶催化机制研究为核心,围绕计算方法开发、抑制剂设计和蛋白活性改造,开展相辅相成的以下课题(附代表性论文各1篇):

(1) 萜类天然产物生源机制研究和酶活性定向改造。

Chen, N. ; Wang, S.; Smentek, L.; Hess, B.*; Wu, R.* . Biosynthetic Mechanism of Lanosterol: Cyclization. Angew. Chem. Int. Ed. 2015, 54,8693-8696.

(2) 组蛋白去乙酰化酶(HDAC)分子机制研究和选择性抑制剂设计

Zhou, J.; Li, M.; Chen, N.; Wang, S.; Luo, H.; Zhang, Y.*; Wu, R.* Computational Design of a Time-Dependent Histone Deacetylase 2 Selective Inhibitor. ACS Chem. Biol. 2015, 10, 687-692.

(3) 发展基于QM/MM方法的药物分子设计新策略,开发个性化分子对接打分函数和锌蛋白专属力场。

Wu, R.; Lu, Z.; Cao, Z.; Zhang, Y.* A Transferable Non-bonded Pairwise Force Field to Model Zinc Interactions in Metalloproteins. J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 433-443.

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教学情况

《物理化学》 (药学本科生必修课,约30学时/年,2014年-至今

《计算机在药物研究中的综合实践》 (药学本科生综合大实验,约30学时/年,2013年-至今)

《结构生物学》中“计算结构生物学”部分   (药学本科生选修课,6学时/年,2017年-至今

《量子化学计算在药物设计中的应用》  (药学研究生选修课,60学时/年,2012年-2017

《有机化学》 (医学院本科生必修课,约18学时/年,2012年-2016年)

 

科研项目

(9)国家自然科学基金面上项目:倍半萜环化酶(ATAS和TEAS)催化机制研究及其蛋白活性重设计 (2018-2022,65万,主持)

(8)中山大学超算应用专项:药物-靶标复杂体系的多尺度模拟研究 (2018年,30万,主持)

(7)国家重点研发计划:基于E级高性能计算生物医药应用软件系统及应用 (2017-2021,~40万,课题骨干)

(6) 广东省杰出青年基金项目:靶向环氧角鲨烯环化酶抑制剂(过渡态类似物)的设计与发现 (2016-2020,100万,主持)。

(5)“广东特支计划”:科技创新青年拔尖人才项目 (2016-2019,30万,主持)。

(4)广州市“珠江科技新星”专项:HDAC8亚型选择性抑制剂分子的设计研究 (2015-2017,30万,主持)。

(3)国家自然科学基金面上项目:基于SLEF力场和QM/MM 方法的HDAC2 选择性抑制剂设计研究 (2013-2016, 80万,主持)。

(2)国家自然科学基金青年基金项目:锌蛋白分子力场的开发与应用 (2013-2015,25万,主持)。

(1)中山大学“百人计划”启动基金:量子力学-分子力学组合计算平台的构建及其在药物分子设计中的应用 (2012-2013,40万,主持)。

 

论著专利

一种beta-取代查尔酮类似物及其制备方法和在制备组蛋白去乙酰化酶抑制剂中的应用;专利号:201310618498.3,发文序号:2016030400179340。专利权人: 中山大学(巫瑞波,周经纬,顾琼)。

 

招聘及其他

当前课题组成员还包括特聘正研究员1人、副研究员2人,博士、硕士研究生合计5人。当前本课题组共计5人次获得国家奖学金,已经毕业的4位同学中,1名出国深造、2名进药企做研发、1位在高校任职副教授。欢迎有兴趣的同学报考本组,也欢迎计算化学、计算生物学、化学(生物)信息学相关背景的博士(后)加盟本课题组,具体事宜请咨询邮箱: wurb3@mail.sysu.edu.cn